Comparison of Structures of Crystalline Solids Predicted using PM6 with X-Ray (Home)

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44 Aspartic acid

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Notes: Aspartic acid exists as the Zwitterion. The proton between the
two carboxylate groups has the following structure:
  Distances (A)
A-B    PM6  X-Ray
O-H   1.127 1.040
H - O 1.460 1.540
O - O 2.576 2.577

                      Unit Cell Parameters:       a      b      c   alpha   beta  gamma   Volume  Density
                                     X-Ray:     5.14   6.98   7.62  90.00  99.84  90.00    269.4   1.641
                                       PM6:     5.13   6.38   7.70  89.99 106.16  90.01    242.1   1.826
                 X-Ray                               PM6
 
For X-Ray structure, contact the CCDC: http://www.ccdc.cam.ac.uk/
  Optimized PM6 data set:
 MERS=(2,2,1)
 Aspartic acid
 h=-232.6  hr=NIST
  C         0.22011669 +1    0.2163777 +1   -0.0430342 +1                      0.0000
  H         0.81432039 +1    0.4929917 +1    0.8872482 +1                      0.0000
  H        -0.04454997 +1    1.0839846 +1   -1.9767398 +1                      0.0000
  H         1.18071651 +1    1.8350201 +1   -1.0511128 +1                      0.0000
  N         0.22968963 +1    1.3870088 +1   -1.0075887 +1                      0.0000
  C         0.84289936 +1   -1.0165113 +1   -0.6843982 +1                      0.0000
  H        -3.48452723 +1   -0.1960724 +1   -0.0395017 +1                      0.0000
  H         0.85642226 +1   -1.8594827 +1    0.0585351 +1                      0.0000
  O         3.15546437 +1   -0.5906106 +1   -0.2254454 +1                      0.0000
  C         2.24391583 +1   -0.7729364 +1   -1.1816744 +1                      0.0000
  H         0.22850933 +1   -1.3916343 +1   -1.5486127 +1                      0.0000
  O         2.57646702 +1   -0.7511903 +1   -2.3632601 +1                      0.0000
  C        -1.24378478 +1   -0.0355695 +1    0.3961203 +1                      0.0000
  O        -2.11982450 +1   -0.1447233 +1   -0.5226462 +1                      0.0000
  O        -1.50789631 +1   -0.0762926 +1    1.6088227 +1                      0.0000
  H        -0.44529290 +1    2.1479358 +1   -0.7109516 +1                      0.0000
  C        -2.06248244 +1    3.1896134 +1    1.1748839 +1                      0.0000
  C        -3.51495740 +1    3.5129436 +1    1.6041973 +1                      0.0000
  C        -4.18762215 +1    2.3240173 +1    2.2774804 +1                      0.0000
  C        -5.57544044 +1    2.6402035 +1    2.7707067 +1                      0.0000
  H         0.16806459 +1    2.9558046 +1    1.6177407 +1                      0.0000
  H        -4.24051386 +1    1.4657286 +1    1.5537017 +1                      0.0000
  H        -3.58700116 +1    1.9426280 +1    3.1481293 +1                      0.0000
  H        -3.21932454 +1    4.4245713 +1    3.5131059 +1                      0.0000
  H        -2.77013052 +1    5.4331918 +1    2.2186580 +1                      0.0000
  H        -4.40907609 +1    5.1998650 +1    2.5606243 +1                      0.0000
  H        -4.09679481 +1    3.7864417 +1    0.6655092 +1                      0.0000
  N        -3.47785847 +1    4.7104610 +1    2.5344833 +1                      0.0000
  O        -1.19206292 +1    3.0733178 +1    2.0982604 +1                      0.0000
  O        -1.79908033 +1    3.1015987 +1   -0.0355396 +1                      0.0000
  O        -5.90255812 +1    2.7202471 +1    3.9512788 +1                      0.0000
  O         1.18852900 +1    2.6644691 +1    1.2192536 +1                      0.0000
  C        -0.82018894 +1    0.3220179 +1    4.9818699 +1                      0.0000
  H        -0.22721824 +1    0.6033648 +1    5.9114990 +1                      0.0000
  H        -1.08355335 +1    1.1813570 +1    3.0442622 +1                      0.0000
  H         0.13825873 +1    1.9395149 +1    3.9690664 +1                      0.0000
  N        -0.81163139 +1    1.4888616 +1    4.0126380 +1                      0.0000
  C        -0.19424784 +1   -0.9128790 +1    4.3471033 +1                      0.0000
  H        -4.52029288 +1   -0.0944958 +1    4.9850958 +1                      0.0000
  H        -0.17675355 +1   -1.7505704 +1    5.0961241 +1                      0.0000
  O         2.11997886 +1   -0.4914051 +1    4.8016510 +1                      0.0000
  C         1.20539815 +1   -0.6665037 +1    3.8472919 +1                      0.0000
  H        -0.80835210 +1   -1.2953394 +1    3.4859845 +1                      0.0000
  O         1.53425652 +1   -0.6353531 +1    2.6647516 +1                      0.0000
  C        -2.28367135 +1    0.0690845 +1    5.4207353 +1                      0.0000
  O        -3.15902132 +1   -0.0419161 +1    4.5012010 +1                      0.0000
  O        -2.54937260 +1    0.0295739 +1    6.6330360 +1                      0.0000
  H        -1.48949291 +1    2.2491546 +1    4.3051303 +1                      0.0000
  C        -3.10092403 +1    3.2887667 +1    6.1985225 +1                      0.0000
  C        -4.55370493 +1    3.6096858 +1    6.6289631 +1                      0.0000
  C        -5.22216373 +1    2.4221320 +1    7.3090383 +1                      0.0000
  C        -6.61174470 +1    2.7356277 +1    7.7988432 +1                      0.0000
  H        -0.86494605 +1    3.0570413 +1    6.6408305 +1                      0.0000
  H        -5.27027742 +1    1.5581886 +1    6.5919321 +1                      0.0000
  H        -4.62112933 +1    2.0493018 +1    8.1833025 +1                      0.0000
  H        -4.25847901 +1    4.5302825 +1    8.5337554 +1                      0.0000
  H        -3.81428019 +1    5.5350552 +1    7.2346528 +1                      0.0000
  H        -5.45159621 +1    5.2974748 +1    7.5797017 +1                      0.0000
  H        -5.13836046 +1    3.8778989 +1    5.6901986 +1                      0.0000
  N        -4.51885991 +1    4.8110937 +1    7.5543402 +1                      0.0000
  O        -2.22881221 +1    3.1750721 +1    7.1202781 +1                      0.0000
  O        -2.84013316 +1    3.2004137 +1    4.9875481 +1                      0.0000
  O        -6.94318448 +1    2.8077759 +1    8.9786214 +1                      0.0000
  O         0.15572099 +1    2.7670694 +1    6.2449732 +1                      0.0000
  C         0.34494075 +1    6.5951921 +1   -0.1471481 +1                      0.0000
  H         0.93961818 +1    6.8721935 +1    0.7827764 +1                      0.0000
  H         0.08294429 +1    7.4618164 +1   -2.0818432 +1                      0.0000
  H         1.30542542 +1    8.2145657 +1   -1.1538320 +1                      0.0000
  N         0.35474152 +1    7.7654003 +1   -1.1122366 +1                      0.0000
  C         0.96793337 +1    5.3618841 +1   -0.7875267 +1                      0.0000
  H        -3.36065315 +1    6.1866139 +1   -0.1422861 +1                      0.0000
  H         0.98278354 +1    4.5197939 +1   -0.0435110 +1                      0.0000
  O         3.27930548 +1    5.7914230 +1   -0.3290058 +1                      0.0000
  C         2.36837339 +1    5.6069941 +1   -1.2854511 +1                      0.0000
  H         0.35398408 +1    4.9847170 +1   -1.6509453 +1                      0.0000
  O         2.70105235 +1    5.6288038 +1   -2.4669743 +1                      0.0000
  C        -1.11875918 +1    6.3443982 +1    0.2928977 +1                      0.0000
  O        -1.99568045 +1    6.2364876 +1   -0.6250952 +1                      0.0000
  O        -1.38194884 +1    6.3037146 +1    1.5059046 +1                      0.0000
  H        -0.32182843 +1    8.5255160 +1   -0.8171995 +1                      0.0000
  C        -1.93844872 +1    9.5674325 +1    1.0707212 +1                      0.0000
  C        -3.39141172 +1    9.8905982 +1    1.4988901 +1                      0.0000
  C        -4.06393217 +1    8.7023802 +1    2.1738352 +1                      0.0000
  C        -5.45179414 +1    9.0192272 +1    2.6667273 +1                      0.0000
  H         0.29117417 +1    9.3332762 +1    1.5144251 +1                      0.0000
  H        -4.11669001 +1    7.8429718 +1    1.4513809 +1                      0.0000
  H        -3.46325703 +1    8.3223881 +1    3.0452099 +1                      0.0000
  H        -3.09282294 +1   10.8056039 +1    3.4058162 +1                      0.0000
  H        -2.64893537 +1   11.8130819 +1    2.1088007 +1                      0.0000
  H        -4.28660038 +1   11.5772240 +1    2.4555746 +1                      0.0000
  H        -3.97315370 +1   10.1629407 +1    0.5596253 +1                      0.0000
  N        -3.35446197 +1   11.0895490 +1    2.4275365 +1                      0.0000
  O        -1.06877248 +1    9.4512633 +1    1.9949634 +1                      0.0000
  O        -1.67422848 +1    9.4796169 +1   -0.1394503 +1                      0.0000
  O        -5.77851787 +1    9.1004672 +1    3.8474205 +1                      0.0000
  O         1.31164047 +1    9.0417087 +1    1.1155550 +1                      0.0000
  C        -0.69543585 +1    6.7007948 +1    4.8776832 +1                      0.0000
  H        -0.10215606 +1    6.9825876 +1    5.8069856 +1                      0.0000
  H        -0.95626570 +1    7.5590719 +1    2.9390989 +1                      0.0000
  H         0.26280872 +1    8.3190719 +1    3.8664287 +1                      0.0000
  N        -0.68664537 +1    7.8672383 +1    3.9080041 +1                      0.0000
  C        -0.06933191 +1    5.4655787 +1    4.2438278 +1                      0.0000
  H        -4.39674231 +1    6.2881326 +1    4.8822260 +1                      0.0000
  H        -0.05032650 +1    4.6288222 +1    4.9939170 +1                      0.0000
  O         2.24372501 +1    5.8907771 +1    4.6979166 +1                      0.0000
  C         1.32976543 +1    5.7135443 +1    3.7433566 +1                      0.0000
  H        -0.68297000 +1    5.0808536 +1    3.3835896 +1                      0.0000
  O         1.65878457 +1    5.7440553 +1    2.5608846 +1                      0.0000
  C        -2.15873984 +1    6.4491325 +1    5.3174360 +1                      0.0000
  O        -3.03491889 +1    6.3390837 +1    4.3986496 +1                      0.0000
  O        -2.42367610 +1    6.4096977 +1    6.5300509 +1                      0.0000
  H        -1.36610086 +1    8.6267127 +1    4.1987216 +1                      0.0000
  C        -2.97697359 +1    9.6664521 +1    6.0940648 +1                      0.0000
  C        -4.43032931 +1    9.9870517 +1    6.5235247 +1                      0.0000
  C        -5.09879651 +1    8.8003736 +1    7.2051515 +1                      0.0000
  C        -6.48843569 +1    9.1145780 +1    7.6946559 +1                      0.0000
  H        -0.74223454 +1    9.4349107 +1    6.5373220 +1                      0.0000
  H        -5.14680490 +1    7.9354406 +1    6.4892626 +1                      0.0000
  H        -4.49767431 +1    8.4290876 +1    8.0801116 +1                      0.0000
  H        -4.13228933 +1   10.9106710 +1    8.4264116 +1                      0.0000
  H        -3.69292508 +1   11.9142306 +1    7.1249824 +1                      0.0000
  H        -5.32918068 +1   11.6746646 +1    7.4744578 +1                      0.0000
  H        -5.01470789 +1   10.2541090 +1    5.5841375 +1                      0.0000
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